而到了1939年，在大幅度的削减了民用物资进口之后，日本的进口为29.18亿日元，出口为35.76亿日元，但扣除对无法获取黄金外汇的“日元圈”进出口，进口为22.35亿日元，出口为18.29亿日元，日本经济力的不足，在1939-1940年度即开始表面化。
经济危机首先出现的外在表现是粮食供应不足，1939年的日本本土之大米需求量为8千万石，比1936年上升了近1千万石，而在侵华战争爆发前，日本本土每年仅需从台湾、朝鲜输入1300-1400万石大米。
而此时，由于战争的因素，日本本土的粮产量自1939年起即一直在下降，自台湾，朝鲜输入大米由于战争及当地的军需等因素，输入额逐年下降，1938年为225万吨，1939年为145万吨，1940年则为48万吨。
为了应对日益严重的粮食危机，日本为此想尽了办法，下令农民要将生产的大米及麦子等粮产品，除自己食用及种子外，都要以官价卖给政府。同时在全国范围内实行粮食配给，禁止一般的饭店，餐馆出售米饭。
此外日本政府还在大力宣传食用代用食品，规定早饭不能超过1日元，中饭2.5日元，晚饭5日元，即便如此，仍有900万石的缺口。为此，日本不得不拿出2亿日元的外汇向法属印度支那、泰国等国进口了800万石大米。
紧随粮食危机而来的是电力与煤炭危机，由于煤炭不足，发电量只能满足80%的需求，到1940年，日本所控制的资源只能满足煤炭需求量的88.3%，石油的18.4%，铁矿石的42.4%，铜的43%，铝的15%，铅锌的18.4%。
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