马里亚纳群岛失利的另一个根本原因是作战的基本计划本身有错误。在这方面最突出和最明显的错误是各种海军兵力的部署不当。作战计划的决策者们沿用了他们得意的一着，而这一次却成为致命的一着，即分散部署兵力。
日美联合舰队不是把盟军部队编成一支空前庞大的机动部队，而是采取了分散兵力的方针，结果各部队的兵力都比较薄弱。从战略上看，分散部署在密克罗尼西亚的兵力是不重要的，因为这支兵力的目的仅仅是为了摧毁那里的中华海军设施和短时间占领北方几个小岛，然后再予放弃。
从战术上看，南方部队的作战目的是转移敌人对马里亚纳群岛主攻的注意力，但是以牺牲集中兵力这个肯定的有利条件，换取牵制敌人这个没有把握的好处，无疑地是不妥当的。想要牵制敌人可能牵制不了，而实际上确实是没有达到这个目的。
而且分散兵力还不只限于兵分两路，在密克罗尼西亚和马里亚纳群岛两个地区之内的兵力也是分散的。在北方，英士达的机动部队在高须的战列舰警戒部队之前三百海里单独作战。
马里亚纳群岛各部队分散得尤其荒唐，南云的航空母舰部队在马里亚纳群岛北西；永野修身和尼米兹的战列舰主力在后面三百海里处；近藤的攻略部队主力在马里亚纳群岛的南面或南西；栗田的直接支援部队同攻略部队输送船团则从南西接近马里亚纳群岛。
兵力不集中，对陆、海、空作战都是一种基本战术弱点。在马里亚纳群岛，这一弱点给敌人歼灭南云部队提供了方便条件，因为其它盟军部队都离得很远，一点也不能发挥作用。
南云的航空母舰一旦被歼，盟军方面由于兵力分散而产生的弱点就使日军几乎完全丧失了战斗力。与此相反，美方部队的部署却是很紧凑有力的。在这次作战中，美方部队自始至终都很集中，不论是攻击还是防御，都做到了最大限度的集中兵力。
举个具体例子来说，倘若比较明智地部署兵力，这一战役本来是可取得不同的结果的，譬如主力和南云部队一起行动，由永野修身的几艘庞大的战列舰掩护航空母舰的话，这样兵力就会大大加强。
战列舰和护航舰只的巨大火力将会击退许多来袭的敌机，无疑可以吸引一些进攻的敌机离开倒霉的航空母舰。此外，永野修身还能直接控制战局，而他之所以不能驾驭局势就是因为他距离太远了。如果好好地使用战列舰，本来是可以在战斗中发挥其真正的作用和威力的。
作战计划中存在的另一个错误是，没有把重点牢牢地放在作战的中心目标上——歼灭敌舰队。作战计划的原来的意图是，以进攻马里亚纳群岛作为诱使敌舰队出来决战的手段。
可是日美联合舰队的战术汁划却给航空母舰规定了固定的行动时间表，并规定它们负有支援马里亚纳群岛攻略作战的任务，这样一来就违反了原来的这个意图。
结果使航空母舰失去了为舰队作战要取得成功所必需的行动上的灵活机动性。也许日美联合舰队认为这样做比较安全，因为他们深信，在马里亚纳群岛受到攻击以前，敌舰队是不会离开其基地的。
但是，他们也应该为应付万一发生与此相反的局势作好准备。应该毫不含糊地把歼灭敌舰队定为这次作战的最主要目标，其它一切都应该服从于这个目标。
据此，理应把整个作战推延一些时候，以待瑞鹤号和翔鹤号航空母舰完成准备工作，来加强机动部队的实力。而日美联合舰队由于过分地强调要使马里亚纳群岛登陆作战获取最有利的气候条件而不肯这样做。
进攻前的搜索和侦察计划同样是有缺点和不充分的。由于潜艇推迟了两天从本土出发，它们就完全不可能及时到达阵位，以监视敌舰队向战区接近并向我舰队报警。
而且即使它们能按时就位，由于每艘潜艇是派在基本固定的阵位上，它们能否发现中华部队也是有问题的。
不仅应该规定这些潜艇绝对必须按时到达，而且还应命令它们从马里亚纳群岛北东沿菲律宾群岛一线进行搜索。对菲律宾进行空中侦察的计划对于马里亚纳群岛攻略作战的成败关系重大，但制定得也是很偏狭，很不严密，没有为在这项基本计划如告失败时提供其它办法。
由于作战基本计划中存在这些严重缺陷，使盟军部队司令官们一开头就吃了两个大亏。即便如此，如果他们在战术指挥上不犯错误，似乎可以肯定说结果也不致如此之惨。
有人说，在战斗中双方都会犯错误，而胜利则属于犯错误较少的一方。在马里亚纳群岛海战中，哪一方犯错误更多，这是不言而喻的。的确，把美日双方作战情况加以研究，不能不承认在这次作战中所有错误都是盟军方面的。
南云海军中将犯的错误最多，但这并不等于说他的才干比不上别的司令长官。他的运气不好，因为南云部队是唯一跟敌人真正交锋的盟军部队。他的处境使他不得不作出绝大部分影响战斗结局的决定。
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